دولت با هدف حفظ ماهیت غیرتجاری و غیرانتفاعی مرکز ملی شماره‌گذاری کالا و خدمات، اساسنامه مرکز توسعه تجارت الکترونیکی را اصلاح کرد.
به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی دولت، هیئت وزیران در جلسه مورخ 4/12/1389 بنا به پیشنهاد وزارت بازرگانی و تأیید معاونت برنامه‌ریزی و نظارت راهبردی رییس‌جمهور و به استناد ماده (80) قانون تجارت الکترونیکی ـ مصوب 1382ـ اساسـنامه مرکز توسـعه تجارت الکـترونیکی موضوع تصویـب‌نامه مورخ 29/7/1388 را اصلاح کرد.
بر اساس این اصلاحیه، ماده (1) اساسنامه مرکز توسعه تجارت الکترونیکی بدین ترتیب اصلاح شد: «به منظور نظارت بر حُسن اجرای قانون تجارت الکترونیکی ـ مصوب 1382ـ ، استقرار، پیاده‌سازی و توسعه تجارت الکترونیکی در کشور با استفاده از ابزارها و استانداردهای ملی و بین‌المللی و با عنایت به فرهنگ ایرانی و اسلامی و حمایت از فعالیتهای تجارت الکترونیکی و ارتقای سطح کاربرد فناوری اطلاعات و ارتباطات در اقتصاد و بازرگانی، مرکز توسعه تجارت الکترونیکی از تجمیع مرکز دولتی صدور گواهی الکترونیکی ریشه و کمیته ملی ادیفکت تشکیل و تمامی وظایف، اختیارات، دارایی‌ها، تعهدات و نیـروی انسانی وزارت بازرگانی در حوزه تجارت الکـترونیکی و مراکز یـاد شده و همچنین وظایف حاکمیتی مرکز ملی شماره‌گذاری کالا و خدمات ایران،به مـرکز منتقل می‌شود.» همچنین بند (8) ماده (3) و ماده (13) این اسسنامه حذف شدند.
بدین ترتیب صرفا وظایف حاکمیتی مرکز ملی شماره‌گذاری کالا و خدمات ایران به مرکز توسعه تجارت الکترونیکی منتقل خواهد شد و ماهیت غیرانتفاعی و  غیرتجاری مرکز ملی شماره‌گذاری کالا و خدمات ایران (که بخشی از سهام آن همچنان متعلق به اتاق بازرگانی و صنایع و معادن ایران است) به قوت خود باقی خواهد ماند تا در عضویت آن در موسسه‌های بین‌المللی خللی ایجاد نشود. 
این اصلاحیه به موجب نامه مورخ 25/12/1389 شورای نگهبان به تأیید شورای یادشده رسیده و 17 فروردین 1390 از سوی معاون اول رئیس‌جمهور ابلاغ شده است.