مرکز روابط عمومی وزارت صنعت ،معدن و تجارت در پاسخ به انتشار  مطلبی با عنوان "دکان دونبش سکانداران بزرگترین وزارتخانه‌های اقتصادی" در  سایت رجا نیوز مورخ 95/2/5  جوابیه ای را  به شرح ذیل  منتشر کرد .

مهندس محمدرضا نعمت‌زاده همواره به دارا بودن روحیه کارآفرینی و وظیفه‌شناسی در دوران تصدی‌گری مسئولیت‌های مختلف دولتی از ابتدای انقلاب اسلامی ایران شهرت داشته و ثابت کرده است که می‌توان با توکل به خداوند متعال، حداقل امکانات و با همراهی همکاران دلسوز و توانا در شرایط زمانی مختلف و در تمامی زمینه‌ها اعم از سیاستگذاری و نظارت در قامت یک وزیر، زمینه اجرایی در قامت رییس سازمان صنایع دفاع و توانیر آن هم در دوران دفاع مقدس و در دوران سازندگی در قامت رییس شرکت ملی صنایع پتروشیمی و پالایش و پخش فرآورده‌های نفتی، برای کشور عزت، اقتدار، پیشرفت و درآمد ملی ایجاد نمود.
وی با کوله‌باری از تجربه پس از بازنشستگی در سال 1388 و با شناخت از نیازهای کشور بالاخص در زمینه نیاز مبرم به جذب سرمایه‌گذاری و اجرای اصل «44» قانون اساسی در تعیین محدوده سرمایه‌گذاری‌های بخش خصوصی و تعاونی با دعوت از سرمایه‌گذاران بخش خصوصی، شرکتی را به صورت خانوادگی تشکیل داد تا در زمینه مدیریت طرحها، متقاضیان سرمایه‌گذاری در طرح‌های مختلف صنعتی را یاری نماید.
در این مسیر، شکل همکاری ایشان با شرکت‌هایی که دعوت به همکاری شده‌اند‌، عمدتاً به اینگونه بوده است که ایشان به دلیل تجارب مفیدشان به عنوان رییس یا عضو هیأت مدیره انتخاب شده‌اند اما قبل از اخذ رأی اعتماد از مجلس شورای اسلامی از کلیه سمتهای خود در هیأت مدیره شرکت‌ها استعفا نموده‌اند‌.
عضویت جناب آقای مهندس نعمت‌زاده در هیأت مدیره شرکتهای فوق‌الذکر تنها به دلیل قبول مسئولیت و مدیریت انجام پروژه‌ها بوده و اعتماد سرمایه‌گذاران بخش غیردولتی به ایشان و دعوت از ایشان به همکاری در اجرای پروژه‌های مختلف صنعتی در دوران بازنشستگی و عدم حضور در مشاغل اجرایی، نه تنها خلاف و زیاده‌خواهی تلقی نمی‌شود بلکه گویای توان بالا و اعتماد به نفس ایشان است که به جای هدر دادن اندوخته‌های چهل ساله، خود را ملزم به قبول مسئولیت و انجام کارهای سخت و دشوار در جهت توسعه، عمران و آبادانی کشور نموده‌اند.
گفتنی است برای مدیری که با تشکیل حدود 40 شرکت و طرح جدید در شرکت ملی صنایع پتروشیمی بدون هیچ‌گونه منابع یا تعهد دولتی و ایجاد مجتمع‌های جدید و افزایش تولید، صادرات محصولات پتروشیمی را از 350 میلیون دلار به حدود 15 میلیارد دلار فعلی رسانده است و با سرمایه‌گذاری حدود 5 میلیارد دلاری ظرف 30 ماه حضور در شرکت ملی پالایش و پخش در پالایشگاه‌های شازند اراک، آبادان، تهران، اصفهان، تبریز، لاوان، بندرعباس و افزایش ظرفیت پالایش توانسته است کیفیت محصولات را به استاندارد روز برساند.
لازم به ذکر است با وجود آن که مهندس نعمت‌زاده قبل از قرار گرفتن در معرض رأی نمایندگان ملت استعفای خود را از عضویت هیأت مدیره‌های مذکور اعلام نموده و فرآیند حقوقی آن جهت درج در روزنامه‌ رسمی انجام شده است و دادستان دیوان محاسبات بطور قاطع نیز اعلام کرده است که "‌عضویت آقای نعمت‌زاده در هیچ یک از شرکت‌های خصوصی اثبات و احراز نشد و وی قبل از تصدی وزارت، به خروج و استعفا از هیات مدیره شرکتهای خصوصی اقدام کرده است." (4 آذر ماه 93 سایت خبرگذاری خانه ملت)
متأسفانه شاهد هستیم برخی رسانه‌ها همچنان به دنبال ایجاد فضای تخریب، تهمت و افترا هستند و در نظام اسلامی برای آبروی مسلمان مومن هیچ‌گونه اعتبار و ارزشی قائل نیستند.
در پایان امیدواریم افراد و رسانه‌هایی که با طرح مسایل خلاف واقع در چند ماه اخیر با نادیده گرفتن موازین اخلاقی تمامی تلاش خود را صرف برهم زدن آرامش جامعه و همچنین تضعیف دولت تدبیر و امید نموده‌اند‌، جهت احترام به رأی مردم، در اقدامات خود تجدیدنظر نموده و با پرهیز از طرح مسایل جنجالی و رعایت شئون و موازین اخلاق اسلامی و حقوق شهروندی، همّ خود را مصروف توسعه و پیشرفت کشور عزیزمان نمایند.
ضمناً این وزارتخانه پیگیری حقوقی و قانونی انتشار این خبر کذب را برای خود محفوظ می‌دارد.